Занижение налоговой базы по НДС

По результатам проведения ВНП Организации было установлено занижение налоговой базы по НДС и сумм налога к доплате (данные книг продаж, регистров бух учета не совпадают с данными декларации по НДС). Организацией предоставлены пояснения о том, что это произошло в результате технической ошибки, при этом занижение выручки от реализации в налоговых декларациях по НДС не привело к занижению НДС к доплате в бюджет, так как в декларациях одновременно были занижены и суммы вычетов, что не опровергается проверяющими. К пояснению предоставлены уточненные регистры бухгалтерского учета и первичные документы (счета-фактуры, накладные, Акты и пр.), суммы по которым не отражены в декларации. Эти же документы были приложены Обществом к возражениям на Акт ВНП. Однако при вынесении решения налоговая учла только скорректированные данные по реализации товаров, которые соответствуют данным книги продаж (ссылки в Решении на предоставленные первичные документы отсутствуют), без учета скорректированных данных о налоговых вычетах по НДС, указав при этом, что поскольку вычеты по НДС не заявлялись в налоговой декларации, то у инспекции отсутствовали правовые основания для проверки обоснованности и документального подтверждения данных сумм. Прав ли налоговый орган?